Κύριοι σκοποί των Επιτρόπων Εσωτερικού Ελέγχου αποτελούν:
- Η εξασφάλιση της Νομιμότητας της Διαφάνειας, δηλαδή ο έλεγχος για τη συμμόρφωση των δραστηριοτήτων του Ο.Τ.Α. με τις νομικές διατάξεις και η εξασφάλιση της διαφάνειας στις διαδικασίες λήψης αποφάσεων και στη χρήση των πόρων.
- Η παρακολούθηση της Οικονομικής Διαχείρισης των Κινδύνων, όπου εξετάζονται τα οικονομικά στοιχεία των Ο.Τ.Α. και παρακολουθείται η τήρηση του Προϋπολογισμού τους
- Η Αξιολόγηση Διαχείρισης Κινδύνων ως προς τις διαδικασίες διαχείρισης τους με σκοπό να προτείνουν βελτιώσεις και να αξιολογήσουν τους ενδεχόμενους κινδύνους
- Η παρακολούθηση του Εσωτερικού Ελέγχου, αν υπάρχει δηλαδή αποτελεσματικότητα στους εσωτερικούς ελεγκτικούς μηχανισμούς
- Η ανάλυση και η αξιολόγηση των έργων που υλοποιούνται από τους Ο.Τ.Α. και
- Η συνεργασία με άλλες επιτροπές και υπηρεσίες για την ομαλή λειτουργία και τον συντονισμό των δραστηριοτήτων